我國首次發(fā)布海洋化合物數(shù)據(jù)庫
昨日，在青島舉行的“2018年全球海洋院所領(lǐng)導(dǎo)人會議”上，青島海洋科學(xué)與技術(shù)試點(diǎn)國家實(shí)驗(yàn)室學(xué)術(shù)委員會主任、中國工程院院士管華詩發(fā)布了海洋試點(diǎn)國家實(shí)驗(yàn)室海洋天然產(chǎn)物三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫。這是我國首次正式發(fā)布海洋化合物數(shù)據(jù)庫。
管華詩表示，海洋是一個巨大的藥源寶庫，迄今為止，人們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了約3萬個結(jié)構(gòu)新穎、活性多樣的海洋天然產(chǎn)物。海洋試點(diǎn)國家實(shí)驗(yàn)室、青島海洋生物醫(yī)藥研究院及中國海洋大學(xué)等多個單位聯(lián)合開發(fā)了首個針對海洋天然產(chǎn)物的三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫，該數(shù)據(jù)庫含有約31000個海洋天然產(chǎn)物的準(zhǔn)確三維結(jié)構(gòu)，可直接用于虛擬篩選與智能藥物設(shè)計(jì)，提升海洋藥物開發(fā)速度與效率。
海洋試點(diǎn)國家實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建了全球首個包含3萬余個人類已知的海洋化合物的3D數(shù)據(jù)庫、首次完成170余個美國FDA批準(zhǔn)的腫瘤藥物靶點(diǎn)對海洋化合物數(shù)據(jù)庫的精確篩選，發(fā)現(xiàn)1000余個具有開發(fā)前景的抗腫瘤藥物苗頭分子，經(jīng)過生物學(xué)、藥理藥效學(xué)分析，海洋藥物篩選準(zhǔn)確率由20%以下躍升到70%以上。
海洋試點(diǎn)國家實(shí)驗(yàn)室創(chuàng)立的“智能超算耦合生物實(shí)測”的創(chuàng)新海洋藥物篩選體系實(shí)現(xiàn)了“快速篩選、高效驗(yàn)證和準(zhǔn)確尋靶”的目標(biāo)，該系統(tǒng)不再依賴于大量的海洋化合物實(shí)體，而是利用計(jì)算機(jī)仿真，將知識層面的海洋化合物轉(zhuǎn)化為虛擬分子數(shù)據(jù)，并用于藥物篩選，解決了創(chuàng)新海洋藥物開發(fā)的“化合物獲取困難”這一最大瓶頸問題。這是世界上首次利用超級計(jì)算機(jī)技術(shù)、生物技術(shù)和藥物設(shè)計(jì)的積累，系統(tǒng)性地對已有的蛋白靶點(diǎn)和所有的化合物進(jìn)行成藥性潛力評估，這一體系的建成將極大地推動我國藥物開發(fā)事業(yè)的發(fā)展。(王建高 王寧 高倩)
